wade20250715/dsh-pubmed

README 摘要

dsh-pubmed DeepSeek Harness 的 PubMed 深度检索工具集。七个工具，全部走 NCBI E-utilities 公共接口， 零 API key、零本地重依赖 。 为什么做这个 dsh 生态里学术检索插件清一色是 arXiv / dblp / OpenAlex / Crossref（偏计算机与综合方向）， 没有一个专注 PubMed 这个生物医学权威库 。本项目补上这个空位，并把"深度调查"能力带进来——不止搜文献，还能查作者、做同名消歧、统计机构发文、匹配导师学生、核查撤稿。 工具清单 工具 作用 关键参数 pubmed search 文献检索，返回命中数与 PMID 列表 query （支持 [Author] / [Affiliation] 等字段标签）、 retmax 、 sort 、 mindate 、 maxdate pubmed fetch 批量拉取文献元数据（标题/期刊/年份/作者/DOI） pmids （逗号分隔） pubmed author 作者发文调查 fullname （全名拼音）、 affiliation （可选）、 retmax pubmed disambiguate 同名作者消歧（按机构区分） fullname 、 affiliation 、 retmax pubmed institution 机构发文统计（含逐年分布） institution 、 mindate 、 maxdate 、 retmax pubmed mentor match 导师-学生共同署名匹配 mentor 、 student 、 affiliation （可选） pubmed retraction 撤稿 / 学术不端核查 query （人名或主题）、 retmax 安装 本地开发时可用 file 协议： 装完后重启 dsh 即可，工具会出现在 agent 的工具列表里。 使用示例 → agent 会依次调用 pubmed author （查发文量）、 pubmed disambiguate （按机构消歧）。 → pubmed institution 。 → pubmed retraction 。 重要提示：中文作者检索 PubMed 对中文作者用「姓前名后」的全名拼音索引。查"靳紫翔"要写 Jin Zixiang ，而不是 Zixiang Jin （后者命中为 0）。这是 PubMed 的索引规则，不是本工具的问题。 安全 - 本插件只请求 eutils.ncbi.nlm.nih.gov （NCBI 公共接口），不需要、也不读取任何 API key。 - 不读取你的 DeepSeek 凭据，不做任何网络请求到第三方。 - 代码零运行时依赖（Node 内置 fetch），无 npm 子依赖注入风险。 已知限制 1. 限速 ：NCBI…

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