PandaAIDD/dsh-molecule-viewer

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dsh-molecule-viewer DSH（DeepSeek Harness）分子结构查看器插件：传入分子文件路径或 PDB/SDF/MOL2/MOL 格式数据，在会话界面渲染 交互式 3D 分子查看器 （3Dmol.js，支持旋转/缩放/样式切换/着色）。 特性 - 🧬 四种格式 ：PDB（蛋白质/大分子）、SDF、MOL2、MOL - 📁 路径优先 ：直接传文件路径，工具在服务端读取——Windows（ D:\dir\x.pdb ）、WSL（ /mnt/d/dir/x.pdb ）和 / 写法都能自动识别互转 - 🖱️ 交互式查看器 ：旋转、缩放，实时切换 cartoon / stick / line / sphere 样式、背景色与分子着色 - ⚡ 轻量解析 ：Host 侧只做原子计数与校验，真正的解析渲染交给浏览器端 3Dmol.js - 📦 本地打包 3Dmol.js ： vendor/3Dmol-min.cjs （2.4.2）在构建时打进 client bundle —— 无 CDN 运行时请求，加载快、可离线、不受浏览器跟踪防护影响 安装 重启生效： 安装后 view molecule 工具自动可用，模型按工具描述自动调用。 dsh plugin 是 pnpm 转发器：克隆仓库 → 安装到 profile 的 node modules → 检测到 dsh.bundle.patch 声明 → 自动加入 dsh.profile.bundles 。peerDependencies 从 profile 的 healed node modules 解析。 使用 对话中直接描述需求即可，模型会自动调用工具： "帮我可视化这个分子：D:\project\Dock\data\3IPQ.pdb" 或明确要求： "用 view molecule 工具查看这段 SDF 数据：..." 支持的格式 格式 扩展名 说明 PDB .pdb .ent 蛋白质/大分子（ATOM/HETATM 记录） SDF .sdf .sd 多分子结构（V2000/V3000） MOL2 .mol2 TRIPOS 格式 MOL .mol MDL MOL（V2000/V3000） SMILES 暂不支持——需要含 3D 坐标的格式。 工具参数 参数 类型 必填 说明 path string 与 data 二选一（ 优先 ） 分子文件路径，按用户原始写法传入即可（Windows/WSL 双向兼容， / 自动展开）；服务端直接读取，速度快 data string 与 path 二选一 分子文件纯文本内容——仅用于磁盘上没有文件的情况（如聊天中粘贴的内容），不要 base64 编码 format pdb \ sdf \ mol2 \ mol 传 data 时必填 输入格式；传 path 时…

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